农业污水是指农牧业生产活动中排出的各类影响人体健康和环境质量的液态物质，主要来源于农田径流、饲养场污水和农产品加工过程。这些废水中含有氮磷化肥残留物、以及其他污染物等有害成分。

随着农业发展和化学肥料的大量使用，大量未被农作物吸收的化学物质会残留在土壤中或漂浮在空气中；之后会通过降雨和地表水流动进入水体系统造成污染。其中高残留的难降解对水质的影响尤为严重。另外牲畜的粪尿以及农产品的加工废水也是重要的污染源之一：未经处理的排泄物和工艺用水排放到环境中会造成土壤和水体的二次污染并破坏生态平衡。例如湖泊河流等地表水域中营养元素的富导致藻类迅速繁殖形成富营养化现象降低水的自净能力从而影响整个水生生态系统的健康运转。同时水中的病原体和其他有毒有害物质还会对人类饮用水源构成威胁进而影响人类生活质量和身体健康水平。