农业污水处理设备的工作原理主要是通过物理处理法、化学法和生物发酵四种方法来去除污水中悬浮物和有毒有害物质。具体来说，该设备的进水口处设有过滤器和絮凝池等预处理器组；污水经过格栅拦截后进入调节水解酸化反应区与大分子有机污染物断链和水溶性变化,同时降解部分难分解的有毒有致癌的化合物;后续的处理单元为曝气沉砂沉淀塘(多级跌落式组合)，对固体颗粒进行缓冲和处理以防止浮油上漂并根据需要将大部分污染重的初级产物除去以保证主要工艺流程不被堵塞的现象发生从而保证整个装置正常运行达到节能降耗的目的。